目前國內在海藻污水處理中常用的方法有物化和生化兩種處理法：

  物化方法中常用的是混凝沉淀與混凝氣浮，對于色度較高的海藻膠廢水亦可在其后串聯活性炭吸附、光氧化、化學藥劑氧化等。混凝沉淀或氣浮是通過在水中投加絮凝劑、助凝劑，使水中的懸浮物或膠體態物質形成大塊絮體，然后通過沉淀或上浮的手段使之與水分離。對于某些廢水亦可加入部分脫色劑，以保證廢水排放色度的達標。

海藻清洗污水處理設備工藝流程：

  調節池廢水提升至氣浮池,在混合反應池中投加混凝劑和助凝劑,經過混合、反應后，然后進入氣浮處理系統進行懸浮物的分離，混凝劑選用PAC，必要也.可加少量脫色劑，助凝劑選用PAM。氣浮裝置一方面可以提高對色度的去除效果，確保出水的色度指標滿足要求，同時還可以對在接觸氧化池中脫落的生物膜進行去除。氣浮后，自流至水解酸化池，通過兼性菌的水解酸化，提高廢水的可生化性，為后續好氧生物處理創造穩定可靠的條件。水解池內設置穿孔曝氣管，防止污水厭氧。

  生物接觸氧化處理系統是靠附著在填料上的生物膜去除廢水中的有機污染物的。生物膜是微生物在載體表面上生長形成的膜狀物質，在膜的表面和一-定深度的內部生長繁殖著大量的微生物和微型后生動物，并形成有機污染物-細菌-原生動物(后生動物)的食物鏈。由于生物膜的高度親水性，在其外側總存在著一層附著水層。在污水不斷在其表面更新的條件下，有機污染物由流動水層傳遞給附著水層，然后進入生物膜，并通過細菌的代謝活動而被降解。從而，污水得到凈化，同時生物膜也越長越厚。生物膜老化后從填料上脫落下來，形成污泥。

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